Do ảnh hưởng của hoàn lưu bão số 3, từ ngày 8 đến ngày 9/9, trên địa bàn tỉnh Hà Giang có mưa vừa, mưa to và rất to khiến nước sông Lô dâng cao khiến nhiều nơi có nguy cơ ngập lụt. Tại địa bàn thành phố Hà Giang, nhiều phường, xã đã xảy ra tình trạng ngập lụt như phường Minh Khai, Ngọc Hà, Nguyễn Trãi, xã Phương Thiện… Trước tình hình đó, các địa phương đã triển khai lực lượng bố tại chỗ, khẩn trương di dời người dân khi nước lũ về.