Hai vấn đề chính của san hô hiện nay là tẩy trắng và gãy đổ do tác động từ biến đổi khí hậu và các hoạt động của con người. Để bảo tồn loài vật quý giá này, chính phủ các nước và các tổ chức bảo vệ thiên nhiên đang và đã hiện thực hoá nhiều kế hoạch nghiên cứu và đánh giá cụ thể. Australia là một trong những nước đi đầu trong nỗ lực bảo tồn và phục hồi quần thể san hô Great Barrier.
